民國五十年秋，嘉義縣議會通過籌設縣立第三中學議案，派陳嘉雄先生籌備設校，即刻辦理招生工作，錄取新生八班，男女兼收，並暫借華南商職教室授課，又積極選擇理想校地興建校舍。五十一年八月本校奉准正式成立，定名為「嘉義縣立蘭潭初級中學」，並派陳嘉雄先生為首任校長，而校舍工程亦次第竣工啟用，五十二年四月二十日陳校長始宣誓就職，並訂是日為校慶日。陳校長雄才大略，除充實設備、整建操場，更興建完成雄偉壯觀的校門，同時督勵教師認真教學，使本校無論升學或各項活動，均有優良績效。至五十七年實施九年國民義務教育，本校奉令改制為「嘉義縣立蘭潭國民中學」，專收男生，由於學生人數之增加，校舍亦跟著擴建，遂有今日之規模。七十一年七月隨嘉義市改制為省轄市，本校亦更名為「嘉義市立蘭潭國民中學」。七十六年度奉准辦理「美術實驗班」，男女兼收。
民國六十二年二月，陳校長出任嘉義縣縣長，遺缺由新港國中校長何瑞仁接任。六十五年八月，何校長奉令與北興國中校長何文琳互調。至六十六年二月何文琳校長榮調民雄高中校長，乃由玉山國中校長吳清松調任。七十一年三月一日，吳校長奉調南興國中校長，繼由嘉義縣政府主任督學沈豐茂接長本校。七十四年四月，沈豐茂校長榮調嘉義縣政府教育局局長，遺缺由台南縣東原國中校長沈高全接任。七十八年三月一日沈校長奉調嘉義國中校長，繼由嘉義縣中埔國中校長鄭文燦接長本校。八十二年八月一日鄭校長榮調新營高中校長，乃繼由本市大業國中葉義雄校長接任。八十九年一月三十一日葉校長榮退，繼由莊正祥校長接任。九十八年二月一日莊校長榮調本市北園國中校長，繼由陳仁輝校長接任迄今。
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